High Resolution HLA Typing توسط تکنیک بسیار قدرتمند NGS

مقدمه

تشخیص دقیق HLA (High Resolution HLA Typing) با استفاده از تکنیک‌های پیشرفته توالی‌یابی نسل جدید (Next-Generation Sequencing یا NGS)، یکی از مهم‌ترین خدماتی است که در آزمایشگاه ژنتیک پزشکی ویرا ارائه می‌شود. این روش نه تنها دقت بسیار بالایی در شناسایی انواع آنتی‌ژن‌های لوکوس انسانی (HLA) دارد، بلکه در حوزه‌های مختلف پزشکی نظیر پیوند اعضا، تشخیص بیماری‌های خودایمنی و بررسی سازگاری دارویی کاربرد گسترده‌ای دارد. در این مقاله به بررسی کاربردها و مزایای این روش پرداخته و نقش آن در پیشگیری از مشکلات مرتبط با HLA را توضیح می‌دهیم.

HLA چیست؟

آنتی‌ژن‌های لوکوس انسانی (HLA) مجموعه‌ای از ژن‌های پیچیده در کروموزوم ۶ هستند که نقش کلیدی در سیستم ایمنی بدن ایفا می‌کنند. HLA با شناسایی سلول‌های خودی از غیرخودی، به سیستم ایمنی کمک می‌کند تا به طور موثر با پاتوژن‌ها و سلول‌های سرطانی مبارزه کند. تنوع ژنتیکی بسیار زیاد این ژن‌ها، شناسایی دقیق و کامل انواع HLA را به یک چالش علمی تبدیل کرده است.

کاربردهای High Resolution HLA Typing

تعیین دقیق HLA با استفاده از تکنیک NGS، کاربردهای متعددی در زمینه‌های مختلف پزشکی دارد:

1. پیوند اعضا و سلول‌های بنیادی:
   • سازگاری گیرنده و اهداکننده: برای کاهش خطر رد پیوند، شناسایی دقیق انواع HLA بسیار حیاتی است. با استفاده از NGS، می‌توان انطباق دقیق‌تری بین گیرنده و اهداکننده پیدا کرد و احتمال موفقیت پیوند را افزایش داد.
   • پیشگیری از عوارض پیوند: رد پیوند یا عوارض ناشی از عدم تطابق HLA، می‌تواند منجر به مشکلات جدی برای بیمار شود. تایپینگ دقیق HLA به پیشگیری از این عوارض کمک می‌کند.
2. تشخیص بیماری‌های خودایمنی:
   • بسیاری از بیماری‌های خودایمنی نظیر دیابت نوع 1، بیماری سلیاک و آرتریت روماتوئید با انواع خاصی از HLA مرتبط هستند. تشخیص دقیق HLA به شناسایی و مدیریت بهتر این بیماری‌ها کمک می‌کند.
3. سازگاری دارویی (Pharmacogenomics):
   • برخی از داروها با انواع خاصی از HLA تداخل دارند و ممکن است واکنش‌های ناخواسته‌ای ایجاد کنند. برای مثال، بیماران دارای آلل HLA-B*57:01 به احتمال زیاد به داروی Abacavir واکنش آلرژیک شدید نشان می‌دهند. با تایپینگ دقیق HLA می‌توان از این مشکلات پیشگیری کرد.
4. مطالعات ژنتیکی و اپیدمیولوژیک:
   • شناسایی دقیق انواع HLA در جمعیت‌های مختلف، اطلاعات مهمی در زمینه تفاوت‌های ژنتیکی و حساسیت‌های مختلف به بیماری‌ها ارائه می‌دهد.

مزایای High Resolution HLA Typing به روش NGS

توالی‌یابی نسل جدید یا NGS (Next-Generation Sequencing)، یک تکنیک پیشرفته ژنتیکی است که امکان توالی‌یابی سریع و دقیق میلیون‌ها قطعه DNA را به‌طور همزمان فراهم می‌کند. این روش، در مقایسه با تکنیک‌های قدیمی‌تر، مانند PCR و Sanger Sequencing، دقت، سرعت و توان تفکیک بالاتری دارد و می‌تواند تغییرات ژنتیکی را با جزئیات بیشتری شناسایی کند.

1. دقت و تفکیک‌پذیری بالا:
   • NGS قادر است تمام انواع ژن‌های HLA را با دقت بسیار بالایی شناسایی کند. این روش با ارائه اطلاعات کامل‌تر، احتمال خطا در تشخیص را به حداقل می‌رساند.
2. شناسایی انواع جدید و نادر:
   • به دلیل تفکیک‌پذیری بالای NGS، این روش می‌تواند انواع جدید و نادری از آلل‌های HLA را که با روش‌های قدیمی قابل شناسایی نیستند، تشخیص دهد.
3. سرعت بالا:
   • در مقایسه با روش‌های قدیمی‌تر مانند SSO (Sequence-Specific Oligonucleotide) و SSP (Sequence-Specific Primer), روش NGS سرعت بالاتری دارد و در زمان کمتری اطلاعات کامل‌تری ارائه می‌دهد.
4. پوشش کامل ژنوم HLA:
   • NGS قادر است تمام نواحی ژن‌های HLA را با دقت بالا مورد بررسی قرار دهد. این پوشش جامع به شناسایی دقیق تمامی آلل‌ها و نواحی کلیدی کمک می‌کند.
5. کاهش هزینه‌ها در بلندمدت:
   • با وجود هزینه‌های اولیه بالاتر، NGS به دلیل کاهش تعداد آزمایش‌های تکراری و ارائه اطلاعات جامع‌تر، در بلندمدت هزینه‌های مرتبط با تشخیص و درمان را کاهش می‌دهد.

 

High Resolution HLA Typing با روش NGS

پروفایلینگ HLA به روش NGS به معنای تعیین دقیق توالی‌های ژن‌های HLA با استفاده از تکنیک توالی‌یابی نسل جدید است. این روش به دلیل تفکیک‌پذیری بسیار بالا و توانایی شناسایی تمامی آلل‌های HLA، به عنوان استاندارد طلایی برای تشخیص دقیق ژنتیکی شناخته می‌شود. در اینجا به مراحل اصلی پروفایلینگ HLA به روش NGS اشاره می‌کنیم:

1. استخراج DNA:
   • نمونه DNA از خون یا سایر بافت‌های بدن استخراج می‌شود. کیفیت و خلوص DNA استخراج‌شده بسیار مهم است، زیرا نتایج پروفایلینگ به شدت به آن وابسته است.
2. آماده‌سازی کتابخانه ژنی:
   • قطعات DNA با استفاده از آنزیم‌های خاص به بخش‌های کوچکتر تقسیم می‌شوند و سپس برای توالی‌یابی آماده می‌شوند. این فرآیند شامل افزودن قطعات آداپتور به انتهای قطعات DNA است.
3. توالی‌یابی (Sequencing):
   • کتابخانه ژنی آماده‌شده به دستگاه NGS وارد می‌شود و دستگاه به‌طور همزمان میلیون‌ها قطعه DNA را توالی‌یابی می‌کند. این فرآیند اطلاعات دقیقی درباره توالی‌های ژنی HLA فراهم می‌کند.
4. تحلیل داده‌ها:
   • داده‌های توالی‌یابی با استفاده از نرم‌افزارهای تخصصی تحلیل می‌شوند تا انواع مختلف آلل‌های HLA شناسایی شوند. این مرحله شامل تطبیق داده‌ها با پایگاه‌های اطلاعاتی ژنتیکی برای شناسایی آلل‌های شناخته‌شده و جدید است.

 

خدمات پروفایلینگ HLA به روش NGS در آزمایشگاه ژنتیک پزشکی ویرا

آزمایشگاه ژنتیک پزشکی ویرا با بهره‌گیری از جدیدترین تجهیزات NGS و تیم متخصص ژنتیک، خدمات پروفایلینگ HLA با تفکیک بالا را با بالاترین دقت و کیفیت ارائه می‌دهد. این آزمایشگاه با ارائه نتایج دقیق و قابل اعتماد، به بیماران و پزشکان کمک می‌کند تا بهترین تصمیمات درمانی را اتخاذ کنند.

• تجهیزات پیشرفته: آزمایشگاه ویرا با استفاده از دستگاه‌های پیشرفته NGS، امکان توالی‌یابی دقیق و سریع را فراهم کرده است.
• تیم متخصص: تیم متخصص ژنتیک آزمایشگاه ویرا با بهره‌گیری از دانش و تجربه کافی، خدمات مشاوره و تحلیل نتایج پروفایلینگ HLA را ارائه می‌دهد.
• پشتیبانی از پزشکان و مراکز درمانی: آزمایشگاه ویرا با ارائه نتایج دقیق و قابل اعتماد، امکان همکاری نزدیک با پزشکان و مراکز درمانی را فراهم می‌کند.

جمع‌بندی

تعیین دقیق HLA با استفاده از تکنیک NGS، به عنوان یکی از جدیدترین و دقیق‌ترین روش‌های تشخیصی، نقش حیاتی در بهبود نتایج درمانی در پیوند اعضا، تشخیص بیماری‌های خودایمنی و سازگاری دارویی دارد. آزمایشگاه ژنتیک پزشکی ویرا با ارائه خدمات تخصصی High Resolution HLA Typing، به بیماران و پزشکان کمک می‌کند تا بهترین تصمیمات درمانی را بر اساس اطلاعات دقیق ژنتیکی اتخاذ کنند. این خدمات پیشرفته، نقش مهمی در پیشگیری از مشکلات مرتبط با HLA و افزایش کیفیت زندگی بیماران دارد.